La UNSAM ha transitado por dos experiencias de autoevaluación y evaluación externa dentro del marco de CONEAU:
1) La primera autoevaluación se realizó en 2000-2001 y la evaluación externa en 2006.
2) La segunda autoevaluación entre 2010 y 2012 y la segunda evaluación externa entre 2013 y 2014.
Evaluación de la función I+D+I
Además, la Universidad desarrolló la autoevaluación de la función Investigación, Desarrollo e Innovación (I+D+i) entre 2012 y 2013, proceso que culminó en 2015 con la evaluación externa del MINCyT.
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La tercera autoevaluación institucional recoge estas experiencias y suma además como antecedente una nueva práctica institucional vinculada a la evaluación de la calidad y la rendición de cuentas: a partir del año 2018 la UNSAM elabora y presenta ante la Asamblea Universitaria el Informe de Gestión Anual y la Cuenta de Ahorro Inversión y Financiamiento correspondiente al año anterior, habiéndose incorporado esta información como obligación de rendición de cuentas anual en el nuevo Estatuto. Las unidades académicas realizan además sus propios informes anuales.